Het upstream-deel omvat het beginstadium van een bioproces waarin microben / cellen worden gekweekt (bijvoorbeeld bacteriële of zoogdiercellijnen in bioreactoren). Upstream-verwerking omvat alle stappen van inoculumontwikkeling: mediapreparatie, celcultuur en celscheiding en -oogst. Wanneer de cellen de gewenste dichtheid hebben bereikt, worden ze geoogst en verplaatst naar de downstream-sectie van het bioproces.